Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ErfP70459 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ErfP70459 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ErfP70459 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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