Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps4xP62702 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms