Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr2fP61219 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2fP61219 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms