Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2d3P61079 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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