Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Chp1P61022 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Chp1P61022 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Chp1P61022 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms