Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Eif3eP60229 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Eif3eP60229 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Eif3eP60229 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3eP60229 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms