Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fermt1P59113 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fermt1P59113 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms