Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dpf3P58269 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms