Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn18P56857 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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