Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmoP56726 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SmoP56726 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SmoP56726 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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