Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp3P49194 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp3P49194 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms