Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cox8bP48772 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cox8bP48772 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms