Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lig1P37913 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lig1P37913 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms