Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin1P35438 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms