Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptk2P34152 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms