Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxa2P31245 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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