Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PdgfraP26618 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfraP26618 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms