Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnnc1P19123 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnnc1P19123 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms