Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PtprcP06800 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtprcP06800 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtprcP06800 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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PtprcP06800 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprcP06800 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtprcP06800 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtprcP06800 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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