Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P04212 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P04212 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P04212 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P04212 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
P04212 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P04212 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms