Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hcn2O88703 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hcn2O88703 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn2O88703 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn2O88703 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn2O88703 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn2O88703 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn2O88703 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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