Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Sorl1O88307 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms