Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Foxq1O70220 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Foxq1O70220 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms