Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zmat3O54836 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zmat3O54836 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms