Protein–RNA interactions for Protein: O35887

Calu, Calumenin, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaluO35887 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CaluO35887 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CaluO35887 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CaluO35887 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CaluO35887 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms