Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Smim18J3QNP2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Smim18J3QNP2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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