Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r34G3XA52 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms