Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Slc9a3G3X939 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms