Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Usp9yF8VPU6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms