Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm3443F7CCV5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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