Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm8005F6YKY3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm8005F6YKY3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm8005F6YKY3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm8005F6YKY3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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