Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc7bE9Q9Y3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc7bE9Q9Y3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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