Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samd1D3YXK1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Samd1D3YXK1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms