Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Prr16A3KMN5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Prr16A3KMN5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Prr16A3KMN5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr16A3KMN5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Prr16A3KMN5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prr16A3KMN5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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