Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ism1A2ATD1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms