Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prdm12A2AJ77 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms