Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mtmr1Q9Z2C4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtmr1Q9Z2C4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mtmr1Q9Z2C4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms