Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cldn6Q9Z262 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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