Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacna2d3Q9Z1L5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms