Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shcbp1Q9Z179 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shcbp1Q9Z179 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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