Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmg20bQ9Z104 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmg20bQ9Z104 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms