Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0K8

Vnn1, Pantetheinase, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn1Q9Z0K8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vnn1Q9Z0K8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms