Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Scn8aQ9WTU3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scn8aQ9WTU3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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