Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ercc4Q9QZD4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms