Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Ehd3Q9QXY6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ehd3Q9QXY6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ehd3Q9QXY6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ehd3Q9QXY6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms