Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim44Q9QXA7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim44Q9QXA7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim44Q9QXA7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim44Q9QXA7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Trim44Q9QXA7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Trim44Q9QXA7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trim44Q9QXA7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms