Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcirg1Q9JHF5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tcirg1Q9JHF5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms