Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc97Q9DBT3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc97Q9DBT3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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