Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc94Q9D6J3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc94Q9D6J3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms