Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn11Q9D572 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn11Q9D572 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms